Центр социально-психологической поддержки учащихся создан в 2025 году и занимается организацией психологической помощи лицеистам, их родителям и сотрудникам Лицея в связи с возникающими у лицеистов психологическими затруднениями в учебной деятельности, развитии и социальной адаптации.

Центр организует профилактические, просветительские, психодиагностические, консультационные, психокоррекционные мероприятия. В каждом здании Лицея есть кабинет психологической помощи, в который можно обратиться, предварительно записавшись. Также в центре работает социальный педагог — к нему можно обращаться по вопросам социальной поддержки, обеспечения соблюдения законных прав учащихся и т.п.